Genomika
Sylabus zajęć
Informacje podstawowe
Kierunek studiów
Specjalność
-
Jednostka organizacyjna
Wydział Biologii
Poziom studiów
Studia drugiego stopnia
Forma studiów
Studia stacjonarne
Profil studiów
Profil ogólnoakademicki
Cykl dydaktyczny
2021-2024
Języki wykładowe
Polski
Obligatoryjność
Obowiązkowy
Blok zajęciowy
Przedmioty nieprzypisane
Prowadzący zajęcia
prof. dr hab. Wojciech Karłowski, wmk@amu.edu.pl
|
Okres
Semestr 1
|
Forma zajęć / liczba godzin / forma zaliczenia
|
Liczba punktów ECTS
5.0
|
Cele kształcenia dla zajęć
Celem modułu jest prezentacja podstawowych informacji, technik i narzędzi związanych z analizami i wykorzystaniem danych genomowych, w szczególności:
1. Przekazanie wiedzy na temat budowy i struktury genomu;
2. Przekazanie wiedzy na temat ewolucji genomów, w tym koncepcji genomu minimalnego i syntetycznego;
3. Zapoznanie z technikami badania zmienności genomowej metodami wysokoprzepustowymi;
4. Wykorzystanie informacji na temat zmienności sekwencji genomowej w badaniach asocjacyjnych;
5. Wykorzystanie technik analiz genomowych w procesie selekcji cech fenotypowych;
Wymagania wstępne
Podstawowa wiedza z zakresu biologii molekularnej i technik bioinformatycznych analiz sekwencji biologicznych.Efekty uczenia się dla zajęć
| Symbol EU dla zajęć/przedmiotu | Po zakończeniu zajęć i potwierdzeniu osiągnięcia EU student/ka: | Symbole EK dla kierunku studiów |
| Efekt_01 | ma podstawową wiedzę na temat budowy i struktury genomu | |
| Efekt_02 | zna mechanizmy molekularne zaangażowane w ewolucję genomów | |
| Efekt_03 | ma wiedzę na temat nowoczesnych trendów w genomice syntetycznej | |
| Efekt_04 | zna techniki wysokoprzepustowe wykorzystywane do określenia zmienności genomowej | |
| Efekt_05 | potrafi wykorzystać dane dotczyące zmienności genetycznej w całogenomwych badaniach asocjacyjnych | |
| Efekt_06 | umie wykorzystać dane dotyczące zmienności na poziomie genomu w procesie selekcji cech fenotypowych |
Treści programowe
| Lp. | Treści programowe dla zajęć/przedmiotu | Symbol EU dla zajęć/przedmiotu |
| 1. |
Budowa i struktura genomu |
Efekt_01 |
| 2. |
Mechanizmy ewolucji genomów |
Efekt_02, Efekt_03 |
| 3. |
Techniki badania zmienności genomowej metodami wysokoprzepustowymi |
Efekt_04 |
| 4. |
Metody umożliwiające powiązanie zmienności genomowej z cechami fenotypowymi |
Efekt_05 |
| 5. |
Techniki wykorzystujące informacje na temat zmienności w skali genowej w procesie selekcji fenotypowej |
Efekt_06 |
Informacje dodatkowe
| Metody i formy prowadzenia zajęć | |
|---|---|
| Wykład z prezentacją multimedialną wybranych zagadnień | |
| Metoda ćwiczeniowa |
| Sposoby oceniania | Symbole EK dla modułu zajęć/przedmiotu | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EK_1 | EK_2 | EK_3 | EK_4 | EK_5 | EK_6 | ||
| Egzamin pisemny | x | x | x | x | x | x | |
| Kolokwium pisemne | x | x | x | x | x | x | |
| Kryteria oceniania wg skali stosowanej w UAM | |
|---|---|
| bardzo dobry (bdb; 5,0): | Student uzyskał zaliczenie z ćwiczeń. Student odpowiedział poprawnie na pytania egzaminacyjne w zakresie powyżej 90% |
| dobry plus (+db; 4,5): | Student uzyskał zaliczenie z ćwiczeń. Student odpowiedział poprawnie na pytania egzaminacyjne w zakresie 81-90% |
| dobry (db; 4,0): | Student uzyskał zaliczenie z ćwiczeń. Student odpowiedział poprawnie na pytania egzaminacyjne w zakresie 71-80% |
| dostateczny plus (+dst; 3,5): | Student uzyskał zaliczenie z ćwiczeń. Student odpowiedział poprawnie na pytania egzaminacyjne w zakresie 61-70% |
| dostateczny (dst; 3,0): | Student uzyskał zaliczenie z ćwiczeń. Student odpowiedział poprawnie na pytania egzaminacyjne w zakresie 51-60% |
| niedostateczny (ndst; 2,0): | Student uzyskał niedostateczną ocenę z ćwiczeń. Student odpowiedział poprawnie na pytania egzaminacyjne w zakresie poniżej 51% |
Literatura
Nakład pracy studenta i punkty ECTS
| Forma aktywności | Średnia liczba godzin* na zrealizowanie aktywności | |
|---|---|---|
| Godziny zajęć (wg planu studiów) z nauczycielem | 60 | |
| Praca własna studenta: | ||
| Przygotowanie do zajęć | 15 | |
| Czytanie wskazanej literatury | 0 | |
| Przygotowanie pracy pisemnej, raportu, prezentacji, demonstracji, itp. | 15 | |
| Przygotowanie projektu | 0 | |
| Przygotowanie pracy semestralnej | 0 | |
| Przygotowanie do egzaminu / zaliczenia | 30 | |
| SUMA GODZIN | 120 | |
| LICZBA PUNKTÓW ECTS DLA MODUŁU ZAJĘĆ/PRZEDMIOTU | 5 | |
* godzina (lekcyjna) oznacza 45 minut